В php.ini (в httpd.conf не работает, только в php.ini): disable_functions=system,exec,passthru,shell_exec,mysql_pconnect, pgsql_pconnect, proc_open,proc_close,dl,show_source
В разных версиях mod_php периодически всплывают грабли приводящие к неимоверному разростанию числа процессов бакенда SQL срвера. Для mysql ситуация несколько лучше, с pgsql_pconnec, до недавнего времени, вообще невозмождно было существовать.