В статье "Encrypted Tunnels with FreeS/WAN's x509 Patch" на примерах показано как в Linux настроить работу IPSec туннеля, соединяющего две локальные сети.
На родном яэыке может будет понятней..... http://gennadi.dyn.ee/modules.php?name=Forums&file=viewtopic&t=2&sid=0a18f80f