В статье "Getting Started with Java on Linux" рассказывается об установке, настройке и тестировании Sun JDK (Java Development Kit) под Linux. В качестве сервера приложений (запуск сервлетов (Servlet 2.3) и JSP скриптов) выбран Resin (отличается очень высокой производительностью). Неплохое, пошаговое руководство. В комментариях можно найти алгоритм установки Jakarta Tomcat.