> давно известны,

...
> недавние атаки

Взаимоисключающие параграфы детектед :)

> crc32 кричит

Он, конечно, кричит, но в хеш-таблице ФС это не сильно очевидно. Это надо развитую фантазию иметь :)

> в остальных фс обычно используют менее тривиальное хэширование

В случае хэш-таблиц никто в общем случае за сложностью генерации коллизионных хэшей не гоняется. Просто потому что как-то так традиционно считается что там криптостойкость не требуется. Вообще, для хэш-таблиц коллизия является штатным сценарием и обрабатывается. Оказалось что в некоторых случаях это может преподнести сюрприз, если некто постарается этот сценарий злонамеренно провоцировать :)

> и деревья,

Радуют меня такие индивиды - мешают в кучу все подряд. Указанное поведение - проблема именно хэш-таблиц. При чем тут деревья вообще? Это иные структуры с иными свойствами. Потенциально деревья кстати не лучше хэш-таблиц. Для дерева O(log(N)) а для таблиц O(1). Вот только как оказалось, можно спровоцировать ситуацию когда O(1) скорее станет похоже на O(N) :)