> каждый раз при обновлении дистрибутива оно самостоятельно доставляет заново весь тот шлак Апдейтер не делает никакой ракетной науки - он переключает репы и делает оттуда апдейт. Если его побочная активность не нравится - можно то же самое сделать просто руками, под чутким ручным контролем.
Из недостатков - вы лишитесь автоматической подчистки того что не требуется. Впрочем оно достаточно фривольно себя ведет и может убить и нечто установленное из сторонних репов которые были отключены при апдейтах. На самом деле - никакой ракетной науки там нет, так что если хочется взять процесс под чуткий ручной контроль - придите и возьмите, если квалификация позволяет понимать что вам в системе надо, а что нет.