сдается мне ты нахально ссылки не привел, и врешь.И я забыл еще одно принципиальное отличие, управлять ключами gconf можно из командной строки.
P.S.
GConf is a system for storing application preferences. It is intended for user preferences; not configuration of something like Apache, or arbitrary data storage.
The GConf database by default uses a system of directories and XML files, stored in a directory called ~/.gconf. GConf can also use other backends, such as a database server, but XML file storage is the most common configuration.