Проблем таже. upload - пормальный, download - глючный.
Единственное сервак стоит под Linux и еще один под Win 2003 (симптомы одинаковые)
ftp качает/загружает - нормально
более того smbclient также качает/загружает нормально.
За время тестирования были полностью заменены сетевые платы, обновлен серверный софт и ядро (Win2003 я уже позже подкрутил, чтобы сравнить скорость закачки).
В общем, пока предполагаю, что проблема на уровне Клиентской ОС, а именно при взаимодействии с разными ОС (ибо между собой файло летает нормально).