Значит что сделал:
1) отключил prelink (prelinking=no)
2) отключил dma (ide=nodma)
3) отключил apic (noapic) из за этого:
Feb 28 16:50:41 sys kernel: ENABLING IO-APIC IRQs
Feb 28 16:50:41 sys kernel: ..TIMER: vector=0x31 apic1=0 pin1=2 apic2=-1 pin2=-1
Feb 28 16:50:41 sys kernel: ..MP-BIOS bug: 8254 timer not connected to IO-APIC
Feb 28 16:50:41 sys kernel: ...trying to set up timer (IRQ0) through the 8259A ... failed.
Feb 28 16:50:41 sys kernel: ...trying to set up timer as Virtual Wire IRQ... works.Но он почему то неотключился =(
Mar 4 03:12:52 sys kernel: Using APIC driver default
Mar 4 03:12:52 sys kernel: ATI board detected. Disabling timer routing over 8254.
Mar 4 03:12:52 sys kernel: ACPI: PM-Timer IO Port: 0x808
Mar 4 03:12:52 sys kernel: ACPI: LAPIC (acpi_id[0x01] lapic_id[0x00] enabled)
Mar 4 03:12:52 sys kernel: Processor #0 15:4 APIC version 16
Mar 4 03:12:52 sys kernel: ACPI: LAPIC (acpi_id[0x02] lapic_id[0x81] disabled)
Mar 4 03:12:52 sys kernel: ACPI: Skipping IOAPIC probe due to 'noapic' option.
Mar 4 03:12:52 sys kernel: Using ACPI for processor (LAPIC) configuration information
Mar 4 03:12:52 sys kernel: Intel MultiProcessor Specification v1.4
Mar 4 03:12:52 sys kernel: Virtual Wire compatibility mode.
Mar 4 03:12:52 sys kernel: OEM ID: ATI Product ID: AMDK8+RS480 APIC at: 0xFEE00000
Mar 4 03:12:52 sys kernel: I/O APIC #1 Version 33 at 0xFEC00000.
Mar 4 03:12:52 sys kernel: Enabling APIC mode: Flat. Using 1 I/O APICs
4) поставил последнее ядро(yum update kernel)
2.6.19-1.2911.6.4.fc6 #1 SMP Sat Feb 24 14:39:04 EST 2007 i686 athlon i386 GNU/Linux
5) отключил SElinux
6) отключил yum-updatesd (так как он иногда занимал по 98% CPU)
сервер повис после аптайма 12 часов еще со старым ядром, счас загрузился с новым аптайм пока 21:44:10 up 18:34. Вообще еще идеи есть на случай если зависнет?